Natsume Tomoharu adalah siswa SMA biasa dalam segala hal, kecuali satu hal: dia diikuti oleh hantu sahabatnya, Misao.
Setelah pindah ke rumah lama kakaknya, Tomoharu berharap dapat melanjutkan hidupnya seperti biasa, namun suatu hari dia ditinggalkan dengan sebuah koper misterius yang terkunci tanpa petunjuk apa pun. Awalnya dia berencana menyimpannya di gudang; namun, rumahnya segera diserbu oleh beberapa kelompok orang yang mengejar koper tersebut. Meskipun masih tidak tahu tujuan koper itu, Tomoharu dan Misao berusaha melarikan diri bersama koper tersebut.
Dari situ, Tomoharu berusaha mengungkap rahasia di balik koper itu, hubungan antara koper dan Misao, serta mengapa koper itu memiliki kekuatan untuk mengubah dunia.