Setelah pertarungan sengit mereka di turnamen nasional, Tim Q4 bubar, dan semua orang kembali ke kehidupan normal mereka. Saat berkunjung ke Card Capital, Aichi Sendou melihat seorang pelanggan yang tidak dikenalnya di dalam toko. Setelah mengajari anak laki-laki yang tertutup itu tentang Cardfight Vanguard, dia menyadari bahwa tumpukan kartu yang biasa dia lihat menjadi sangat berbeda.
Meskipun berisi berbagai unit yang belum pernah dilihat Aichi sebelumnya, semua orang bersikeras bahwa kartu-kartu itu adalah kartu yang sama dengan yang selama ini dia gunakan. Selain itu, anak laki-laki aneh itu menghilang tanpa jejak, membuat Aichi semakin bingung. Saat Aichi mulai terbiasa dengan dek baru yang aneh, dia bertujuan untuk mengungkap misteri di balik insiden dan anak laki-laki aneh itu.
