Bertualang ke hutan belantara, Ryouta Murakami yang skeptis dan Kuroneko yang ambisius sedang dalam perjalanan untuk membuktikan keberadaan kehidupan di luar bumi ketika sebuah kecelakaan tragis terjadi, merenggut nyawa Kuroneko dan meninggalkan Ryouta dalam keadaan terluka parah.
Sepuluh tahun telah berlalu sejak bencana tersebut, dan Ryouta sekarang menjalani kehidupan normal di sekolah menengah. Dia bersumpah untuk membuktikan bahwa alien itu nyata untuk menghormati mendiang temannya. Seorang siswa pindahan bernama Neko Kuroha tiba-tiba datang pada suatu hari, memiliki kemiripan yang mencolok dengan almarhum Kuroneko-bahkan memiliki nama yang sama. Yang paling misterius, dia tampaknya memiliki kekuatan gaib.
Ketika Ryouta semakin tertarik pada Neko, dia ditarik ke dalam dunia yang mematikan di mana para ilmuwan berbahaya memburu para penyihir yang menggunakan sihir yang melarikan diri dari laboratorium penelitian rahasia mereka. Neko adalah salah satu pelarian ini, tetapi ada banyak orang lain yang berada dalam situasi yang sama, dan tergantung pada Ryouta untuk melindungi mereka dari calon penculik mereka.