Dalam novel visual, bendera imajiner didefinisikan sebagai sebuah peristiwa yang berfungsi sebagai titik balik dari keseluruhan cerita. Seorang pemain yang memicu bendera romansa untuk seorang pahlawan wanita akan melanjutkan ke rutenya, atau bendera kematian akan menandakan bahwa karakter tertentu akan mati setelahnya.
Siswa SMA Souta Hatate dapat melihat bendera-bendera ini di atas kepala seseorang, dan memiliki kemampuan untuk menurunkannya untuk menghentikan kejadian tertentu. Dengan menggunakan kekuatan ini, dia telah mencegah kematian orang lain. Namun, setelah kecelakaan di masa lalu yang membuatnya menjadi satu-satunya orang yang selamat, dia akhirnya percaya bahwa hanya kemalangan yang akan menimpa mereka yang berada di dekatnya, dan menahan diri untuk tidak berteman atau menjalin hubungan sejak saat itu.
Namun, semuanya mulai berubah setelah pindah ke sekolah baru. Setelah menjatuhkan bendera kematian lainnya, teman sekelasnya, Nanami Knight Bladefield, menyadari kekuatannya dan mencoba mempelajari lebih lanjut tentang dia, berjanji bahwa dia akan tetap berada di sisinya, apa pun yang terjadi. Maka dimulailah perjalanan Souta saat dia bertemu dengan teman dan kenalan baru sambil mengungkap misteri kemampuannya-yang mungkin lebih dalam dari apa yang diharapkan siapa pun.
