Dalam masyarakat futuristik, Jepang telah menerapkan sistem kompleks yang disebut sebagai “Benang Merah Ilmu Pengetahuan” untuk mendorong pernikahan yang sukses dan memerangi angka kelahiran yang semakin rendah. Berdasarkan perhitungan kecocokan, para remaja di usia 16 tahun telah ditentukan pasangannya oleh pemerintah, dan mereka yang melanggar aturan tersebut akan menerima konsekuensi berat. Bagi Yukari Nejima, seorang remaja yang menganggap dirinya biasa-biasa saja dalam segala hal, sistem ini mungkin merupakan kesempatan terbaiknya untuk menjalani kehidupan yang memuaskan.
Namun, didorong oleh kegilaannya pada teman sekelasnya dan orang yang telah lama ditaksirnya, Misaki Takasaki, Yukari menentang sistem tersebut dan menyatakan cintanya. Setelah beberapa keengganan di awal, Misaki membalas perasaannya dengan penuh gairah. Sayangnya, sebelum keduanya dapat melanjutkan hubungan mereka, Yukari menerima pemberitahuan pernikahannya. Dia kemudian terlempar ke dalam jaringan cinta dan kebohongan yang membingungkan ketika pasangannya yang ditugaskan untuk tidak terlalu senang, Ririna Sanada, menjadi terpesona dengan romansa terlarangnya.