Setelah Akihito Kanbara bertemu kembali dengan Mirai Kuriyama—yang ia yakini telah menghilang setelah mengalahkan Beyond the Boundary—ia menemukan fakta yang memilukan: Mirai telah kehilangan semua ingatan tentangnya, teman-teman mereka, dan masa lalunya sebagai Spirit Warrior. Akihito benar-benar hancur, tetapi menyadari bahwa ia memiliki kesempatan unik. Mirai akhirnya dapat menjalani kehidupan seorang gadis normal—di mana ia akan sepenuhnya terbebas dari masyarakat supernatural yang menjauhi dan memanfaatkannya. Meskipun semua itu demi kebahagiaan Mirai, harganya mahal—Akihito dan teman-temannya harus merahasiakan asal-usul Mirai yang sebenarnya, dan akibatnya menghindari pertemanan dengannya.
Namun, ingatan-ingatan yang mengganggu tentang kehidupan lama Mirai perlahan-lahan mulai muncul kembali, dan kejahatan baru yang misterius membawa sekelompok makhluk seperti bayangan ke kota dengan tujuan mencarinya. Saat situasi menjadi gawat, Akihito harus berjuang untuk melindungi dirinya sendiri, teman-teman terdekatnya, dan Mirai—si cantik berkacamata yang paling disayanginya.
