Koyomi Araragi menghabiskan tahun terakhirnya di sekolah menengah atas dengan membantu gadis-gadis di kotanya mengatasi berbagai masalah supranatural. Namun kini Araragi telah berangkat ke universitas, meninggalkan teman-temannya untuk berjuang sendiri melawan masalah dan kutukan baru yang menimpa mereka. Yotsugi Ononoki, yang dulunya adalah mayat manusia dan kini menjadi boneka hidup, tinggal di rumah Araragi, menjaga saudarinya, Tsukihi, seorang gadis yang menyimpan rahasia mistisnya sendiri. Sebagai bagian dari tugasnya, Yotsugi mengisi peran Araragi yang kosong sebagai ahli okultisme, membantu orang lain di kota itu dengan masalah mereka.
Salah satu gadis ini, siswa sekolah menengah Nadeko Sengoku, perlahan pulih dari pertikaiannya dengan dunia paranormal baru-baru ini. Ia menghindari kembali ke sekolah, malah menghabiskan waktu sendirian di kamarnya dan mengejar mimpinya menjadi seniman manga profesional. Untuk mempercepat pencarian Nadeko untuk menguasai keahliannya, Yotsugi meyakinkannya untuk membuat empat salinan dirinya, yang masing-masing mewakili aspek kepribadian Nadeko yang berbeda. Namun, para klon menolak untuk membantu Nadeko, dan malah melarikan diri ke kota dan menciptakan kekacauan. Kini terpaksa bergulat dengan rasa identitasnya yang terpecah-pecah, Nadeko berusaha menangkap mereka dan menyelesaikan konflik batinnya.
