Saikin, Imouto no Yousu ga Chotto Okashiinda ga. mengisahkan tentang sebuah keluarga yang baru saja mulai membangun kembali. Ketika mereka menikah, Tuan dan Nyonya Kanzaki membawa serta seorang anak laki-laki dan perempuan yang masih remaja. Namun, Mitsuki Kanzaki yang masih duduk di bangku SMA kurang begitu senang. Tersengat oleh sejarah figur ayah yang tidak hadir dan kasar, dia lambat menerima ayah tiri dan saudara tirinya.
Namun setelah sebuah kecelakaan membuat Mitsuki harus dirawat di rumah sakit, ia mendapati dirinya dirasuki oleh hantu Hiyori Kotobuki, seorang gadis seusianya yang jatuh cinta pada saudara tiri Mitsuki, Yuuya. Hiyori tidak dapat meneruskan pahala terakhirnya karena cintanya yang bertepuk sebelah tangan pada Yuuya, yang berarti dia harus menyempurnakannya… di dalam tubuh Mitsuki?!
Sekarang, hidup Mitsuki tergantung pada membawa Hiyori ke Surga. Tapi apakah dia akan terbiasa berbagi dengan hantu yang suka memaksa? Dapatkah ia mengatasi ketidakpercayaannya terhadap keluarga barunya? Dapatkah dia membawa dirinya untuk memenuhi perasaan Hiyori terhadap Yuuya? Dan mungkinkah dia menyembunyikan perasaannya sendiri?
