Shuurei Kou, putri dari keluarga bangsawan namun miskin, adalah seorang gadis cerdas yang bermimpi menjadi pejabat pemerintah dan berkontribusi bagi negaranya. Namun, mimpinya tak tercapai karena posisi tersebut dilarang bagi perempuan. Sementara ayahnya bekerja sebagai arsiparis bergaji rendah di istana, Shuurei harus mengerjakan berbagai pekerjaan sampingan untuk menghidupi diri. Suatu hari, kunjungan tak terduga mengubah hidupnya.
Shuurei dipanggil untuk membantu Ryuuki Shi, kaisar baru yang dikenal malas dalam menjalankan tugasnya dan lebih suka bergaul dengan pria. Tergoda oleh imbalan yang besar, ia dengan senang hati menerima kesempatan untuk menjadi selir kaisar muda selama enam bulan. Beruntung, ia tidak sendirian karena Seiran Shi, sahabatnya yang setia, ikut serta sebagai pengawal Ryuuki. Meskipun bertugas mengubah kaisar baru menjadi penguasa yang bertanggung jawab, kehidupan istana dan politik ternyata rumit, dan Shuurei harus menghadapi tantangan dalam hidup barunya.
Berlatar di negara fiksi, Saiunkoku Monogatari berfokus pada konsep kepemimpinan yang bermakna, tantangan yang dihadapinya, dan imbalan yang datang bersamaan dengan kemakmuran negara.