Segala sesuatunya tidak selalu seperti yang terlihat. Hal ini terutama berlaku untuk Ruuko Kominato, ketika ia menerima setumpuk kartu untuk permainan kartu populer WIXOSS, hanya untuk menemukan seorang gadis yang terperangkap di dalam LRIG, atau kartu avatar. Setelah bertemu dengan orang lain dalam situasi yang sama, Ruuko menemukan bahwa dia sekarang telah menjadi “Selector”, pemain dalam versi khusus WIXOSS di mana para gadis dapat bertarung satu sama lain untuk mendapatkan kesempatan untuk mewujudkan keinginan mereka yang paling dalam. Namun, ada syaratnya. Berbeda dengan kemuliaan yang menanti mereka setelah kemenangan mereka, ada takdir yang kejam: jika mereka kalah tiga kali, hidup mereka akan hancur.
Dalam permainan yang penuh dengan kebohongan dan tipu daya, Ruuko dan teman-teman barunya harus mengungkap rahasia di balik WIXOSS dan menyadari apa yang sebenarnya paling penting bagi mereka sebelum terlambat.
