Shaman adalah individu luar biasa yang memiliki kemampuan untuk berkomunikasi dengan hantu, roh, dan dewa, yang tidak dapat dilihat oleh orang biasa. Pertarungan Shaman-turnamen bergengsi yang mempertemukan para shaman dari seluruh dunia dengan satu sama lain-diadakan setiap lima ratus tahun sekali, dan pemenangnya dinobatkan sebagai Raja Shaman. Gelar ini memungkinkan petahana saat ini untuk memanggil Roh Agung dan membentuk dunia sesuai keinginan mereka.
Karena terlambat masuk kelas pada suatu malam, Manta Oyamada, seorang siswa sekolah menengah pertama, memutuskan untuk mengambil jalan pintas melalui pemakaman setempat. Tanpa disadarinya, seorang anak laki-laki yang duduk di atas nisan mengundang Manta untuk mengamati bintang bersama “mereka”. Menyadari bahwa “mereka” mengacu pada anak laki-laki itu dan teman-teman hantunya, Manta melarikan diri dengan ketakutan. Kemudian, anak laki-laki itu memperkenalkan dirinya sebagai You Asakura, seorang Shaman yang sedang berlatih, dan menunjukkan kekuatannya dengan bekerja sama dengan hantu samurai berusia enam ratus tahun, Amidamaru, untuk menyelamatkan Manta dari sekelompok preman. You berteman dengan Manta karena kemampuannya untuk melihat roh, dan dengan bantuan Amidamaru, mereka berusaha mencapai tujuan You untuk menjadi Raja Shaman berikutnya.
