Pada suatu malam musim gugur di sebuah kedai ramen misterius di belakang Kuil Shimogamo, seorang mahasiswa tahun ketiga yang kesepian bertemu dengan seorang pria berkepala terong yang menyebut dirinya dewa pernikahan. Pertemuan dengan pria ini membuatnya merenungkan dua tahun terakhirnya di kampus—dua tahun yang dihabiskannya dengan getir untuk memutuskan hubungan dengan satu-satunya temannya, Ozu, seorang pria bertampang seram yang tampaknya bertekad membuat hidupnya semenyedihkan mungkin. Bertekad untuk memanfaatkan sisa masa kuliahnya sebaik mungkin, mahasiswa tersebut mencoba mengajak Akashi, adik kelasnya yang tidak ramah namun baik hati, berkencan, tetapi gagal, membuatnya menyesal karena tidak menjalani kehidupan kuliahnya dengan cara yang berbeda. Namun, begitu pikiran ini terlintas di benaknya, ia terlempar melintasi ruang dan waktu ke awal tahun-tahun kuliahnya dan diberi kesempatan lain untuk menjalani hidupnya.
Surealis, artistik, dan membingungkan, Yojouhan Shinwa Taikei mengisahkan petualangan seorang pemuda dalam perjalanan mencari teman, menemukan cinta, dan merasakan kehidupan kampus penuh warna yang selalu diimpikannya.