Tahap kedua dari battle royale yang dikenal sebagai Rencana Sekirei sedang berlangsung. Shintou Teito telah ditutup; tidak ada Sekirei atau Ashikabi yang boleh pergi. Minato Sahashi dan harem Sekirei-nya sekarang harus bersiap untuk bertempur dalam pertempuran baru seiring dengan perubahan aturan yang diberlakukan. Namun, tidak semua kelompok akan kembali bertempur: beberapa Sekirei sangat dicintai oleh pasangan Ashikabi mereka, yang lebih suka kehilangan hadiah daripada melihat mereka binasa. Di tengah-tengah aksi tersebut, seseorang yang dekat dengan Minato mungkin terlibat lebih dari yang ia bayangkan, dan ancaman mengintai di setiap sudut. Bahkan ada rumor bahwa "Bilangan Tunggal," jenis Sekirei yang paling kuat, telah memasuki medan pertempuran. Di mata sang "Game Master", Minaka Hiroto, semuanya berjalan sesuai rencana.